Protein–RNA interactions for Protein: Q921X6

Polr3f, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3fQ921X6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr3fQ921X6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3fQ921X6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3fQ921X6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3fQ921X6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms