Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SncbQ91ZZ3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SncbQ91ZZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms