Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atl3Q91YH5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atl3Q91YH5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Atl3Q91YH5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms