Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdhb12Q91Y07 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdhb12Q91Y07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb12Q91Y07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms