Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps36Q91XD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps36Q91XD6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps36Q91XD6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms