Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nlrp6Q91WS2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nlrp6Q91WS2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlrp6Q91WS2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nlrp6Q91WS2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms