Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zkscan3Q91VW9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan3Q91VW9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zkscan3Q91VW9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 445 ms