Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc44a4Q91VA1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a4Q91VA1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc44a4Q91VA1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc44a4Q91VA1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms