Protein–RNA interactions for Protein: Q91V81

Rbm42, RNA-binding protein 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm42Q91V81 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm42Q91V81 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm42Q91V81 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm42Q91V81 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm42Q91V81 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rbm42Q91V81 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm42Q91V81 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm42Q91V81 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms