Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc1Q8VDD8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Washc1Q8VDD8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Washc1Q8VDD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc1Q8VDD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc1Q8VDD8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc1Q8VDD8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Washc1Q8VDD8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms