Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sgip1Q8VD37 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sgip1Q8VD37 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sgip1Q8VD37 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms