Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8VCE4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8VCE4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q8VCE4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8VCE4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8VCE4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8VCE4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8VCE4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8VCE4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8VCE4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8VCE4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8VCE4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms