Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm8Q8R4D5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm8Q8R4D5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm8Q8R4D5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpm8Q8R4D5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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