Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd8Q8R3B7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brd8Q8R3B7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd8Q8R3B7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brd8Q8R3B7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms