Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab11fip5Q8R361 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip5Q8R361 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms