Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gle1Q8R322 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gle1Q8R322 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gle1Q8R322 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gle1Q8R322 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms