Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim29Q8R2Q0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim29Q8R2Q0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim29Q8R2Q0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms