Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga1Q8R0H9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga1Q8R0H9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga1Q8R0H9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms