Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b4Q8QZY9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b4Q8QZY9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms