Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufs8Q8K3J1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufs8Q8K3J1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs8Q8K3J1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs8Q8K3J1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms