Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud6bQ8K2H2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Otud6bQ8K2H2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Otud6bQ8K2H2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms