Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hacd3Q8K2C9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacd3Q8K2C9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd3Q8K2C9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hacd3Q8K2C9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hacd3Q8K2C9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hacd3Q8K2C9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hacd3Q8K2C9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms