Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scara5Q8K299 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scara5Q8K299 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scara5Q8K299 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scara5Q8K299 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scara5Q8K299 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms