Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1B8

Fermt3, Fermitin family homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt3Q8K1B8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fermt3Q8K1B8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fermt3Q8K1B8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fermt3Q8K1B8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fermt3Q8K1B8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fermt3Q8K1B8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fermt3Q8K1B8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms