Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0P3

Tldc1, TLD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tldc1Q8K0P3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tldc1Q8K0P3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tldc1Q8K0P3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tldc1Q8K0P3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tldc1Q8K0P3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms