Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2-Q4Q8HWB2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
H2-Q4Q8HWB2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-Q4Q8HWB2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms