Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf628Q8CJ78 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf628Q8CJ78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf628Q8CJ78 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms