Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh4a1Q8CHT0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh4a1Q8CHT0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh4a1Q8CHT0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh4a1Q8CHT0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms