Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Setd1bQ8CFT2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Setd1bQ8CFT2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Setd1bQ8CFT2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Setd1bQ8CFT2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Setd1bQ8CFT2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Setd1bQ8CFT2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Setd1bQ8CFT2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms