Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nup88Q8CEC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nup88Q8CEC0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup88Q8CEC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nup88Q8CEC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms