Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl11Q8CE33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl11Q8CE33 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Klhl11Q8CE33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhl11Q8CE33 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl11Q8CE33 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms