Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atad2Q8CDM1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atad2Q8CDM1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atad2Q8CDM1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atad2Q8CDM1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms