Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
6030452D12RikQ8CD33 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
6030452D12RikQ8CD33 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
6030452D12RikQ8CD33 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms