Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt222Q8CCX5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt222Q8CCX5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt222Q8CCX5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt222Q8CCX5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms