Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16223Q8CBM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16223Q8CBM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm16223Q8CBM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm16223Q8CBM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms