Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ephb1Q8CBF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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