Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csgalnact2Q8C1F4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csgalnact2Q8C1F4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Csgalnact2Q8C1F4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csgalnact2Q8C1F4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms