Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrd1Q8C0R9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrd1Q8C0R9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrd1Q8C0R9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrd1Q8C0R9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms