Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVQ5

Ppme1, Protein phosphatase methylesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppme1Q8BVQ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppme1Q8BVQ5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppme1Q8BVQ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppme1Q8BVQ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppme1Q8BVQ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppme1Q8BVQ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppme1Q8BVQ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppme1Q8BVQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppme1Q8BVQ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppme1Q8BVQ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppme1Q8BVQ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms