Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf3c4Q8BMQ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c4Q8BMQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms