Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hirip3Q8BLH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hirip3Q8BLH7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hirip3Q8BLH7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hirip3Q8BLH7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Hirip3Q8BLH7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms