Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Best2Q8BGM5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Best2Q8BGM5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Best2Q8BGM5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms