Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.5Q85ZW7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.5Q85ZW7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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