Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc181Q80ZU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc181Q80ZU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc181Q80ZU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc181Q80ZU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms