Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg2bQ80XK6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg2bQ80XK6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg2bQ80XK6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg2bQ80XK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms