Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Npm2Q80W85 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Npm2Q80W85 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Npm2Q80W85 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Npm2Q80W85 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Npm2Q80W85 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Npm2Q80W85 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms