Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otop3Q80UF9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Otop3Q80UF9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otop3Q80UF9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Otop3Q80UF9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms