Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Avl9Q80U56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Avl9Q80U56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Avl9Q80U56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Avl9Q80U56 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms