Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cul9Q80TT8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cul9Q80TT8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cul9Q80TT8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cul9Q80TT8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul9Q80TT8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cul9Q80TT8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms