Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CyldQ80TQ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CyldQ80TQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CyldQ80TQ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CyldQ80TQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms